Lodrö Gyatso nasce nel 1635 nella regione di Takchuk in Kumbum in Amdo. Da giovane si recò  a Lhasa e immatricolato Università Monastica di Drepung. Cominciò la sua educazione monastica con le letture e le scritture di base, memorizzando testi di preghiera e di importanti testi filosofici. Sotto eminenti studiosi studiò il curriculum monastico Geluk dalla sezione sutra e poi si iscrisse al college per studiare Gyume tantra, con i suoi riti e rituali, disegni mandala e argomenti correlati. Secondo le fonti, Gomang abate Lobzang Ngawang era il suo tutore capo.